定量蛋白质组学非标记（定量蛋白质组学名词解释）
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蛋白质组学的研究方法
1、蛋白组学的研究方法如下：蛋白质组学的发展既是技术所推动的也是受技术限制的。蛋白质组学研究成功与否，很大程度上取决于其技术方法水平的高低。蛋白质研究技术远比基因技术复杂和困难。
2、蛋白质样品的制备：蛋白质样品的制备是蛋白质组学研究的首要环节，也是最为重要的部分。蛋白质样品的质量直接影响到科学研究的真实性和可信度。
3、蛋白质组学的研究内容包括：蛋白质鉴定：可以利用一维电泳和二维电泳并结合Westemn等技术，利用蛋白质芯片和抗体芯片及免疫共沉淀等技术对蛋白质进行鉴定研究。
4、蛋白质相互作用的研究，酵母双杂交和噬菌体展示技术无疑是很好的研究方法。LCM-二维电泳-质谱的技术路线是典型的一条蛋白质组学研究的技术路线，除此以外，LCM-抗体芯片也是一条重要的蛋白质组学研究的技术路线。
多组学高分文献14-乳腺癌定量蛋白质组学和蛋白质组学前景
1、多组学研究在精准医学中的应用案例 多组学研究已经在精准医学中得到了广泛的应用。
2、蛋白质间的“相互作用组（interactome）”是我见过的最复杂的现象。代谢，以及代谢组学的学科，可以说是破朔迷离的蛋白质组学的主战场，从小分子，到以生物能量的角度洞察生命的真谛。
3、近年来质谱技术的进步有力地推动了蛋白质组学和代谢组学的研究，使临床将蛋白组学和代谢组学引入疾病的早期诊断成为现实。
蛋白质组学实验设计、质控与分析
1、易瑞生物拥有一支经验丰富的蛋白质组学团队，可以为客户提供高质量的蛋白质组学产品。
2、蛋白质组学的研究方法有蛋白质鉴定、翻译后修饰、蛋白质功能确定、蛋白质靶向定量技术。蛋白质鉴定：可以利用一维电泳和二维电泳并结合Western等技术，利用蛋白质芯片和抗体芯片及免疫共沉淀等技术对蛋白质进行鉴定研究。
3、将蛋白质组数据与其他组学数据（如转录组或代谢组数据）进行整合，从多层面理解差异蛋白的生物学含义。 生物标志物筛选 如果研究的目标是寻找疾病的生物标志物，进一步分析差异蛋白的诊断、预测和治疗价值。
4、建议实验设计如下所示：方案二 —— 蛋白质组学+差异蛋白功能验证 该思路是对方案一进行了延伸。
5、蛋白质组学的基本技术流程主要为以下四方面：蛋白质标本的制备及分离：寻找较好的方法尽可能完全地抽提细胞或组织中的全部蛋白质是比较蛋白质组学研究的重要前提。
蛋白质组学中对缺失值的处理
1、DDA label-free一般较多，10%-50% 的缺失值。过滤标准不定，如一个蛋白中三个重复，2个有值，建议保留，1个有值，严格一点考虑过滤掉。不建议用均值、中位值或最小值来进行填充。
2、全局校正(global adjustment)标准化是蛋白质组学中常用的方法之一，它将log化的intensity数据的中心转换成一个常数，这个常数可以是mean、median或者其它数学测量指标。
3、(1)均值插补。数据的属性分为定距型和非定距型。
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