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蛋白质测序方法,蛋白质测序方法有哪几种

发布时间:2024-06-21 18:05:04 蛋白质 0次 作者:健康资讯网

大家好,今天小编关注到一个比较有意思的话题,就是关于蛋白质测序方法的问题,于是小编就整理了4个相关介绍蛋白质测序方法的解答,让我们一起看看吧。

蛋白质工程的核心流程和操作对象?

1.蛋白质工程的核心流程:预期蛋白质功能--设计预期的蛋白质--推测应有的氨基酸序列--找到对应的脱氧核苷酸序列

蛋白质测序方法,蛋白质测序方法有哪几种

2.蛋白质工程的操作对象:基因

3.蛋白质工程是对现有蛋白质的改造或制造新的蛋白质,需要通过基因的修饰或基因的合成。

蛋白质工程的基本流程简述如下:筛选纯化需要改造的目的蛋白,研究其特性常数等;制备结晶,并通过氨基酸测序、X射线晶体衍射分析、核磁共振分析等研究,获得蛋白质结构与功能相关的数据;结合生物信息学的方法对蛋白质的改造进行分析;由氨基酸序列及其化学结构预测蛋白质的空间结构,确定蛋白质结构与功能的关系,进而从中找出可以修饰的位点和可能的途径;根据氨基酸序列设计核酸引物或探针,并从cDNA文库中获取编码该蛋白的基因序列;在基因改造方案设计的基础上,对编码蛋白质的基因序列进行改造,并在不同的表达系统中表达;分离纯化表达产物,并对表达产物的结构和功能进行检测等。

要知道目的基因是否表达,在分子水平上检测和个体水平上检测都是如何进行的?

在分子水平上检测目的基因是否表达通常包括以下步骤:

核酸水平检测:通过分子杂交等技术检测目的基因的转录本,以确定目的基因是否正在被转录成mRNA。

蛋白质水平检测:通过蛋白质印迹法、免疫沉淀法等技术检测目的基因的翻译产物,以确定目的基因是否正在被翻译成蛋白质。

生物活性检测:检测目的基因编码的蛋白质是否具有生物活性,以确定目的基因是否能够正常表达并发挥其功能。

在个体水平上检测目的基因是否表达通常包括以下步骤:

表型水平检测:检测个体是否表现出目的基因所控制的性状,以确定目的基因是否正常表达并发挥其功能。

组织水平检测:检测不同组织中目的基因的表达水平,以确定目的基因是否在不同组织中正常表达。

细胞水平检测:检测单个细胞中目的基因的表达水平,以确定目的基因是否在细胞内正常表达。

基因组和蛋白质组的区别?

基因组:以生物体所有的核酸为研究对象,狭义的基因组定义为生命体的全套DNA,广义的基因组则包含DNA、mRNA、lncRNA等参与到基因表达调控的所有核酸序列。其主要研究手段为基因测序,以华大基因为代表。转录组通常可认为是基因组的简化研究手段,即所有转录本的集合。

蛋白组:生物体基因组所编码的全套蛋白质。鉴于蛋白质表达的时空特异性,各组织器官或者特定亚细胞结构器(如线粒体、叶绿体),甚至是外泌蛋白,也可以成为一个蛋白组。所以蛋白质组是信号转导、分子发育最为直接的手段。其主要研究手段为生物质谱,在国内以牟合蛋白为典型。

分子生物学鉴定步骤?

首先你要提出细菌的DNA。方法如下:

1、液体培养及保种:从斜面上挑取菌苔于液体培养基中放摇床上震荡(转速160r/min)培养16小时。吸取菌液于1.5ml的经过灭菌的EP管中,再加甘油(30-40%)进行保种。(-80摄氏度保藏2年)

2、提取DNA(CTAB法): (1)取1.5ml菌液于1. 5ml离心管中,12000r/min离心2min,弃上清。 (2)向沉淀物中加入350ul双蒸水,重新悬浮沉淀。

(3)加入20ul10%SDS和3ul的蛋白酶K(20mg/ml),溶菌酶3ul,混匀,于50℃温育1h。

(4)加入50ul 5mol/L NaCl溶液,充分混匀,再加入50ul CTAB/NaCl溶液,混合后再65℃温育30min。

(5)冷却后加入等体积的酚(沉淀蛋白质):氯仿:异戊醇(增强酚的作用)(25:24:1),小心上下颠倒混匀,12000r/min离心5min,将上清液转移到新的EP管,重复此步骤2-3次,直至分层界面无白色沉淀。

(6)加入等体积的氯仿:异戊醇(24:1),小心颠倒混匀,12000r/min离心5min将上清液转移到新的EP管。(纯化作用)

(7)加入0.6倍体积的异丙醇,轻轻混合直到DNA沉淀下来,12000r/min离心15min弃上清。

(8)向离心管中加入75%乙醇,12000r/min离心5min洗涤DNA沉淀,小心弃上清,重复洗涤1次,弃上清将离心管倒置于吸水纸上,晾干。

(9)加入50ul(双蒸水)/ TE Buffer溶解DNA于4℃保存。

(10)电泳检测6、PCR扩增:(细菌的通用引物为27F和1492R)将提取得到的DNA进行PCR扩增,电泳检测扩增得到的16S rDNA(如果菌类分明,条带清晰,PCR原液可直接送去测序,双向测通,得到测序序列后到NCBI的BLAST页面比对,得出鉴定结果)。

到此,以上就是小编对于蛋白质测序方法的问题就介绍到这了,希望介绍关于蛋白质测序方法的4点解答对大家有用。